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紫外线杀菌消毒是利用适当波长的紫外线能够破坏微生物机体细胞中的DNA（脱氧核糖核酸）或RNA（核糖核酸）的分子结构，造成生长性细胞死亡和（或）再生性细胞死亡，达到杀菌消毒的效果。紫外线消毒技术是基于现代防疫学、医学和光动力学的基础上，利用特殊设计的率、高强度和命的UVC波段紫外光照射流水，将水中各种细菌、病毒、寄生虫、水藻以及其他病原体直接杀死。
紫外线系统的经济学决定于以下因素：设备造价和寿命；电效率；运行中杀菌效果的降低程度；电费等。对于紫外线消毒系统的经济分析尚未做出定论，有很多结论不同的分析报道，有观点认为紫外线杀菌装置电耗大，设备维护费和造价较高。对于大系统，设备投资比臭氧系统高，运行费用与臭氧相仿；但对于纯净水制造的小型系统投资较臭氧装置为低。也有观点认为对于数千吨/日以上的处理规模，紫外线消毒系统的投资和运行成本很具优势，要比加氯和臭氧消毒的花费都低得多。例如有分析资料报道，在建造人口数为10~25000范围的小型饮用水处理厂时，紫外线、二氧化氯和臭氧消毒费用的近似比例为1:4：（8~9），对于人口数大于500000的社会团体，费用比约为1:2.5:2.5。
范围及条件
2.3.4.1 紫外线可以杀灭各种微生物，包括细菌繁殖体、芽胞、分支杆菌、病毒、真菌、立克次体和支原体等，凡被上述微生物污染的表面，水和空气均可采用紫外线消毒。
2.3.4.2 紫外线辐照能量低，穿透力弱，仅能杀灭直接照射到的微生物，因此消毒时使消毒部位充分暴露于紫外线下。
2.3.4.3 用紫外线消毒纸张、织物等粗糙表面时，要适当延长照射时间，且两面均应受到照射。
2.3.4.4 紫外线消毒的适宜温度范围是20-40℃，温度过高过低均会影响消毒效果，可适当延长消毒时间，用于空气消毒时，消毒环境的相对湿度低于80%为好，否则应适当延长照射时间。
2.3.4.5 用紫外线杀灭被有机物保护的微生物时，应加大照射剂量。空气和水中的悬浮粒子也可影响消毒效果。
辐照剂量是所用紫外线灯在照射物品表面处的辐照强度和照射时间的乘积。因此，根据紫外线光源的辐照强度，可以计算出需要照射的时间。例如，用辐照强度为70 uW/CM2的紫外线表面消毒器近距离照射物品表面；选择的辐照剂量是100000 uW.s/CM2；则需照射的时间是：
100000 uW.s/CM2 ÷70 uW/CM2=24分钟。
人们利用紫外线杀菌原理把的杀菌消毒技术又引入了日常生活的杀菌消毒领域，这种应用在日常生活中的室内、家居、车载、冰箱杀菌器和工业用杀菌器都是利用高频C波段紫外线在20秒至1分钟内对各种微生物的DNA产生破坏作用，能够杀死99%的和病毒，包括： 流感、肝炎病毒、大肠、金黄葡萄球菌、枯草黑色变种芽孢及多种霉源体、源，给人群提供安全的衣食住行环境，特别适用于餐具、个人和公共物品、玩具以及其他物品的表面快速消毒、除臭除味、清新空气等。
当紫外线照射到微生物时，便发生能量的传递和积累，积累结果造成微生物的灭活，从而达到消毒的目的。当、病毒吸收超过3600~65000uW/c㎡剂量时，对、病毒的去氧核醣核酸（DNA）及核醣核酸（RNA）具有强大破坏力，能使、病毒丧失生存力及繁殖力进而消灭、病毒，达到消毒灭菌成效。紫外线一方面可使核酸突变、阻碍其复制、转录封锁及蛋白质的合成；另一方面，产生自由基可引起光电离，从而导致细胞的。
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